Охрана природных комплексов и объектов парка осуществляется службой охраны, состоящей из государственных инспекторов в области охраны окружающей среды. Главным государственным инспектором является директор национального парка «Угра». Непосредственное руководство службой охраны возложено на заместителя директора по охране территории. Во главе каждого лесничества стоит старший государственный инспектор в области охраны окружающей среды, в подчинении которого находятся участковый государственный инспектор и государственные инспектора.
На территории парка постоянно действуют 3 патрульные оперативные группы: «Север», «Центр» и «Юг», ежедневно патрулирующие территорию. В состав патрульной группы входят старший государственный инспектор, у которого в подчинении находятся государственные инспектора. Госинспекция оснащена специальной техникой: автомобили повышенной проходимости, лодки с лодочными моторами, квадроциклы, снегоходы, средства фото- и видеофиксации нарушений (персональные видеорегистраторы, фотоаппараты). Отдел охраны занимается ведением административных дел, возбужденных государственными инспекторами.
Сотрудники службы охраны парка (госинспектора в области охраны окружающей среды) наделены следующими правами:
- привлекать нарушителей природоохранного законодательства к административной и иной ответственности;
- задерживать лиц, нарушивших законодательство РФ об особо охраняемых природных территориях (ООПТ), на территории национального парка, его охранной зоны и доставлять их в правоохранительные органы;
- прекращать любую хозяйственную деятельность, противоречащую режиму ООПТ;
- изымать у нарушителей орудия и продукцию незаконного природопользования;
- производить в установленном порядке досмотр транспортных средств, вещей, а также личный досмотр;
- применять при исполнении служебных обязанностей физическую силу и, в установленном порядке, специальные средства – наручники, резиновые палки, слезоточивый газ, устройства для принудительной остановки транспорта и т.д.;
- другими правами в соответствии с законодательством РФ.
Государственная инспекция осуществляет контроль за соблюдением природоохранного законодательства и специального охранного режима парка. В обязанности сотрудников отдела охраны (государственных инспекторов) входит:
- борьба с браконьерством;
- выявление и документальное фиксирование нарушений природоохранного законодательства;
- проведение учётов охотничьих видов животных и птиц;
- профилактическая работа с посетителями парка.
Количество нарушений природоохранного режима парка существенно меняется в зависимости от сезона года. Так в летний период основными нарушениями являются: организация туристских стоянок и разведение костров за пределами специально предусмотренных для этого мест, заезд в водоохранную зону и езда вне дорог общего пользования, использование лодочных моторов, осуществление поисковой деятельности с использованием металлодетекторов. В зимний, весенний и осенний период основными нарушениями являются несоблюдение требований охотничьего законодательства и нарушение правил рыболовства.