Мониторинг включает сбор и анализ данных о компонентах природной среды и объектах историко-культурного наследия, их оценку и прогноз изменений. Мониторинг компонентов природной среды позволяет оценить их состояние и спрогнозировать их реакцию на различные изменения условий, в том числе глобальные изменения климата. Данные мониторинга необходимы для принятия своевременных регуляционных мер и управленческих решений.
В национальном парке реализуются следующие направления мониторинга.
К многолетним (более 10 лет) рядам наблюдений относятся:
- ежегодные зимние маршрутные учеты численности охотничье-промысловых видов зверей и птиц
- фенологические наблюдения
- гидрологический мониторинг пойменных озер
- рождественские учеты зимующих птиц
Также с различной периодичностью осуществляются:
- мониторинг популяций редких и уязвимых видов растений и животных (ковыль перистый, венечник ветвистый, русская выхухоль, зубр и др.)
- мониторинг ключевых ботанических территорий
- мониторинг флоры засечных лесов под влиянием вольного выпаса крупных копытных (зубров)
- мониторинг растительности на Залидовских лугах
- мониторинг урожайности ягодников (клюквы)
- мониторинг ключевых орнитологических территорий
- мониторинг эпизоотологической ситуации и мелких позвоночных
- мониторинг поселений муравьев Formica
- гидрохимический и гидробиологический мониторинг поверхностных водных объектов
- мониторинг рекреационного воздействия на природные комплексы
- мониторинг состояния памятников истории и культуры
