В типичную схему инвентаризации входит учет и составление списков животных и растений, ценных экосистем, историко-культурных объектов, с дальнейшим их картированием и созданием ГИС. Полученные данные используются при планировании охранной, эколого-просветительской и туристической деятельности.В национальном парке с различной периодичностью ведутся инвентаризационные работы по следующим направлениям.
Инвентаризация биоты и природных комплексов:
- инвентаризация сосудистых растений, мохообразных, грибов, лишайников, водорослей
- инвентаризация фитоценотического разнообразия
- инвентаризация фауны позвоночных животных
- инвентаризация фауны наземных беспозвоночных животных
- комплексная инвентаризация ценных экосистем и природных объектов: болот, пойменных озер
Инвентаризация объектов историко-культурного наследия:
- инвентаризация археологических объектов
- инвентаризация традиционных жилых построек, храмов, дворянских усадеб
- инвентаризация объектов традиционного природопользования
- инвентаризация воинских захоронений и памятных знаков